伊能静在2000年与歌手庾澄庆结婚，不过两人在2009年宣告离婚育有1子“小哈利”。在2015年伊能静与大陆演员秦昊再婚，去年6月喜迎“小米粒”出世，再婚生活依旧相当幸福。不过日前2人一同录制育儿节目《妈妈是超人》，但男方育儿方式引起争议，事后，伊能静跳出来发文护夫，不过网友留言：“感觉还是哈林适合你”，伊能静也针对留言回应了！

在日前播出的育儿实境节目中，伊能静因为左眼皮肿胀到快看不见东西，只好在半夜临时去看医生。对此，秦昊却叮嘱着老婆要赶紧回家，因为怕自己一个人无法搞定夜里醒来的小米粒，此举更让伊能静在该节目受访时吐露心声，她形容当时“累到极点”、“很想大哭”，这些片段播出后引来网友砲轰，认为秦昊很不负责任，第一时间，伊能静发微博澄清秦昊是个好爸爸，只是因为节目剪辑关系引发误会。